Programy dodatkowe w systemie FreeBSD mogą być zainstalowana poprzez tzw. porty lub poprzez manager pakietów pkg i dlatego aktualizuje się je w inny sposób.
Uaktualnienie programów zainstalowanych poprzez porty (z równoczesnym uaktualnieniem programów zainstalowanych poprzez pkg z przerzuceniem ich na porty):
za pierwszym razem po instalacji systemu: sudo portsnap fetch extract przy kolejnych aktualizacjach wystarczy: sudo portsnap fetch update sudo portmaster -a
Uaktualnienie programów zainstalowanych poprzez manager pakietów pkg:
pkg update pkg upgrade